بدأ مشروع تنمية قدرات أعضاء هيئة التدريس والقيادات (FLDP ) فى سبتمبر 2004 كنتيجة لمؤتمر تطوير التعليم العالى و الذى عقد عام 2000 ، و قد أثمر هذا المؤتمر عن إقرار البدء بالعمل فى حزمة برامج  لتطوير منظومة التعليم العالى ، منها مشروع تنمية قدرات أعضاء هيئة التدريس و القيادات  (FLDP)، واستمر العمل فى المشروع منذ بدايته فى سبتمبر 2004 من خلال ستة مراحل تنتهى فى يوليو 2008.

و قد استقل المشروع عن المجلس الأعلى للجامعات فى يوليو 2008  ، و أصبح مركز تنمية القدرات والتدريب المستمر (CDOT) .

و أصبح المركز وحدة ذات طابع خاص لها استقلال فنى ومالي و إداري بقرار مجلس الجامعة رقم (68) بتاريخ 24/11/2009 .

وتم تغيير مسمى المركز من مركز تنمية القدرات والتدريب المستمر (CDOT)  إلى مركز تنمية قدرات أعضاء هيئة التدريس والقيادات (FLDC) ، وذلك فى اجتماع مجلس إدارة المركز فى جلسته رقم (1) بتاريخ 28/12/2010 .

صدرت موافقة المجلس الأعلى للجامعات بجلسته رقم (230) بتاريخ 25/7/2022 على إنشاء مركز تنمية قدرات أعضاء هيئة التدريس و القيادات (وحدة ذات طابع خاص) و اعتماد لائحته المالية و الإدارية.